Zalesienie wyspy wynosi 20%. Dwa główne kompleksy leśne Almindingen dodatkowo Rø Plantage są zbiorowiskami sztucznymi, powstałymi wewnątrz wyniku nasadzeń przeprowadzonych w środku początkach XIX w. Stanowią je drzewostany mieszane (głównie iglaste). Resztki pierwotnych drzewostanów liściastych zachowały się zaledwie na wybrzeżach. Typowym naturalnym biotopem Bornholmu są wrzosowiska pokrywające skały (których najwięcej jest na północy wyspy).
Większość terenów wyspy stanowią wielkoobszarowe użytki rolne. Dzięki korzystnemu klimatowi na wyspie rosną orchidee plus anemony, aklimatyzowano z sukcesem kilkanaście gatunków roślin śródziemnomorskich, do wnętrza tym figowce, brzoskwinie, morwy, morele plus inne. Bornholm jest znany jako „zieloną wyspą” (w porównaniu z innymi obszarami Danii) – z tego powodu flagą Bornholmu jest przeróbka flagi narodowej, do wnętrza której krzyż ma zielony kolor.
Fauna lądowa wyspy jest zbliżona do fauny Danii również płd. Szwecji. Sztucznie introdukowanym gatunkiem ssaków jest daniel. Wyspa jest znana z dużej liczby dorodnych jeży, które czasami stanowią rzecz (zwłaszcza na kempingach). Bogata jest ornitofauna, zwłaszcza reprezentowana wskroś ptaki morskie, także ptaki migrujące ze Skandynawii. Rezerwaty ornitologiczne znajdują się do wnętrza okolicach Nexø również na wyspie Græsholm (w obrębie archipelagu Ertholmene). W wodach morskich okolic Bornholmu występują śledzie (Clupea harengus), dorsze (Gadus morhua) , łososie (Salmo salar), troć wędrowna (Salmo trutta m. trutta), flądry (Pleuronectiformes) plus inne ryby bałtyckie.